アプリの対応はまだ完全ではない
iOS9にすることで不具合の出るアプリはあります。自分がメインで使っているアプリは大丈夫なのか、確認をしてからアップデートする必要があります。例えばモンスターストライクはLINEでマルチプレイ時に不具合が出ると公式から発表されています。
個人的には、将棋系のアプリが何故か英語表記になってしまう不具合にやられました。棋士名も英語表記になる部分は設定で変更できましたが、棋譜の部分、つまり「8四歩」が「P-8d」と表示されるのは非常に不便です。アップデートに期待しています。

見た目はほとんど変わっていない
今回のデザインもiOS7から続くフラットデザインです。外見的な変更はほとんどありません。少し目立つのは、システムフォントが「Helvetica Neue」から「San Francisco」に変わったところでしょうか。英数字の部分が変更されているので、一番わかりやすいのが画面上部の時計の数値です。若干小さく、間隔が空いているので、人によっては違和感があると思います。